17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1090 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2797  hypothetical protein  82.35 
 
 		 71 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  47.62 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  46.03 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  41.07 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  42.37 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  36.07 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  32.84 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  30.88 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  30.3 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  32.81 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  35.38 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  31.34 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  33.87 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  32.31 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>