15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2797 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2797  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  140  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  82.35 
 
 
69 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  40.85 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  42.25 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  41.79 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  38.81 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  27.94 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  34.38 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  32.81 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  37.88 
 
 
65 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  28.36 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>