31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0269 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  100 
 
 		 67 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  71.21 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  35.82 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  37.29 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  30.88 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  35.59 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  31.34 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  37.29 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  36.36 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  34.92 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  37.29 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  35.94 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  35.59 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  35.94 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  35.48 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  29.69 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  35.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0448  hypothetical protein  32.79 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000908926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  43.55 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  42.19 
 
 		 67 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  33.87 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  38.71 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  41.94 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  32.2 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  40.32 
 
 		 62 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>