20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2751 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  42.37 
 
 
72 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  44.07 
 
 
91 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  37.88 
 
 
72 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  41.07 
 
 
69 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  36.36 
 
 
73 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  40.91 
 
 
65 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  35 
 
 
64 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  35 
 
 
64 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  43.55 
 
 
63 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  33.87 
 
 
67 aa  45.8  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  37.1 
 
 
61 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  40 
 
 
62 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  36.51 
 
 
70 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  36.51 
 
 
70 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2797  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>