16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1062 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  92.19 
 
 		 64 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1250  hypothetical protein  90.62 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  52.31 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  44.62 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  43.33 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  35 
 
 		 303 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  34.38 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  41.94 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  37.1 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  35.48 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  35 
 
 		 91 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  43.28 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1022  hypothetical protein  40.62 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.493994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>