41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2628 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  49.21 
 
 		 70 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  44.62 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  49.21 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  44.93 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  43.94 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0723  hypothetical protein  39.34 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2126  hypothetical protein  43.48 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000775092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  39.13 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  41.54 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  44.62 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  41.43 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  42.19 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  39.44 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  41.43 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  39.39 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  34.33 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  37.14 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  34.33 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  42.42 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  33.82 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  40.3 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  37.14 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  39.06 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  41.54 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  36.51 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  38.03 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  34.29 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  38.81 
 
 		 61 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  35.94 
 
 		 83 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  35.94 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  40.98 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1022  hypothetical protein  34.33 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.493994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  37.88 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  41.27 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  27.14 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  34.78 
 
 		 72 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>