46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2258 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  153  7e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  42.25 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  43.75 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  41.94 
 
 
62 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  44.93 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  35.71 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  33.8 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  42.37 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  43.1 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  35.21 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  38.1 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  32.31 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  40.32 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  34.43 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  41.38 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  34.43 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4037  hypothetical protein  32.31 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649084  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  40.32 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  35.62 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  36.21 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  45.16 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  39.39 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2478  hypothetical protein  49.12 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  32.31 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  38.6 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  37.93 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  36.36 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  41.38 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  37.93 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  41.54 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  43.33 
 
 
63 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  38.18 
 
 
63 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  38.71 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  47.46 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  39.66 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>