71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0336 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  69.49 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  66.13 
 
 		 65 aa  87.4  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  70.18 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  66.13 
 
 		 64 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  64.52 
 
 		 63 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  67.8 
 
 		 61 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  64.52 
 
 		 65 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  61.29 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  61.29 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  59.32 
 
 		 64 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  55.74 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  61.67 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  58.06 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  63.79 
 
 		 63 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  59.68 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  58.06 
 
 		 62 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  57.14 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1189  hypothetical protein  56.6 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  54.84 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  53.23 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  54.84 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  47.54 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  55.74 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  51.67 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  50.88 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  53.57 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  45.16 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  54.84 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  48.39 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  53.12 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  51.61 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  52.46 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0851  hypothetical protein  56.45 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0738922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  46.67 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  46.77 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  50.72 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  49.23 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  49.23 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  48.53 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  42.37 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  48.44 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  38.98 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0121  hypothetical protein  50.85 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  43.66 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0120  hypothetical protein  50.85 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1458  hypothetical protein  47.17 
 
 		 58 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187723  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  41.27 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  40.35 
 
 		 83 aa  47.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  40.98 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  38.81 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4037  hypothetical protein  41.38 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649084  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  45.16 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  40.3 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  36.36 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2478  hypothetical protein  42.37 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1025  hypothetical protein  42.25 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0283  hypothetical protein  40.35 
 
 		 127 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  39.71 
 
 		 68 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  40.62 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0117  hypothetical protein  36.36 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0348  hypothetical protein  35.09 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>