73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0204 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  73.44 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  78.95 
 
 		 70 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  67.74 
 
 		 63 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  66.13 
 
 		 62 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  57.81 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  65.62 
 
 		 65 aa  84.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  65.62 
 
 		 65 aa  84.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  62.9 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  60.94 
 
 		 64 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  62.71 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  65.08 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  61.67 
 
 		 62 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  66.1 
 
 		 68 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  56.45 
 
 		 63 aa  76.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  59.32 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  56.06 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  51.61 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  54.84 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1189  hypothetical protein  52.73 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  60 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  52.54 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  54.69 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  54.69 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  49.15 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  50.85 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  51.61 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  50.79 
 
 		 62 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0851  hypothetical protein  56.45 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0738922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  50.77 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  50.77 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  48.21 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  47.46 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  50.85 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1458  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  40.58 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0120  hypothetical protein  47.46 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0121  hypothetical protein  47.46 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  40.62 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  44.78 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  40.68 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  38.81 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1300  hypothetical protein  46.27 
 
 		 66 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.428744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  46.88 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  44.07 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  42.11 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4037  hypothetical protein  41.38 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649084  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  35.59 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1721  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0117  hypothetical protein  34.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  39.34 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0348  hypothetical protein  34.38 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  42.65 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  35.48 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  37.5 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  33.87 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.54 
 
 		 366 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0276  hypothetical protein  34.38 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0334  hypothetical protein  34.38 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0302  hypothetical protein  34.38 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0273  hypothetical protein  34.38 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0289  hypothetical protein  34.38 
 
 		 125 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>