52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1189 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1189  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  72.13 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  64.29 
 
 
65 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  64.29 
 
 
65 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  58.93 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  58.93 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  48.28 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  59.26 
 
 
62 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  52.73 
 
 
64 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  56.6 
 
 
62 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  52.46 
 
 
65 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  60.38 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  47.37 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  59.62 
 
 
62 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  57.14 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  52.73 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  52.63 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  51.85 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  54 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  55.36 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  50.88 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  56 
 
 
61 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  49.09 
 
 
62 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  53.85 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  46.55 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  48.21 
 
 
63 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  54 
 
 
61 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  46.55 
 
 
67 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  48.21 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  45.61 
 
 
63 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0851  hypothetical protein  54.72 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0738922  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  47.27 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  44.44 
 
 
72 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  35 
 
 
67 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0120  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0121  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  47.27 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  42.11 
 
 
61 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  47.27 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  42.19 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  42.19 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  42.11 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  39.34 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  41.82 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  38.1 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1458  hypothetical protein  53.12 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  42.11 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  38.71 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  44.07 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.727128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>