17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0117 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0117  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1721  hypothetical protein  62.5 
 
 
64 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1025  hypothetical protein  36.62 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  44.26 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  39.39 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  34.85 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  37.88 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3052  hypothetical protein  38.36 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4224  hypothetical protein  38.36 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  39.39 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  37.14 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  34.85 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  36.36 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  33.82 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  40.3 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>