19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1025 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1025  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  144  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1689  hypothetical protein  44.29 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94474  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0430  hypothetical protein  43.59 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  42.47 
 
 
72 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4224  hypothetical protein  42.47 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  41.43 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0117  hypothetical protein  36.62 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  41.1 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  43.06 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2774  hypothetical protein  43.42 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  41.43 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1721  hypothetical protein  37.14 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  44.29 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  36.23 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  42.25 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  38.89 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  40.85 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  38.81 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>