14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1689 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1689  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  149  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94474  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  38.67 
 
 
91 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  40.85 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1025  hypothetical protein  44.29 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  41.89 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  40 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  41.43 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  36.76 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  39.73 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  39.73 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  36.36 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0723  hypothetical protein  38.03 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  34.29 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>