43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1458 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1458  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  57.41 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  56 
 
 
62 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  76.47 
 
 
63 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  56.86 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  55.36 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0121  hypothetical protein  65.85 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0120  hypothetical protein  65.85 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  73.33 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  72.73 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  72.73 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  61.76 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  52.83 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  56.82 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  54.35 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  53.7 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  66.67 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  56 
 
 
61 aa  50.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3655  hypothetical protein  78.57 
 
 
39 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00625223  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  47.17 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  52 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  57.14 
 
 
62 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  41.07 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  46.3 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  48.84 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  71.43 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  47.06 
 
 
63 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  50.88 
 
 
65 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  51.92 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0851  hypothetical protein  62.07 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0738922  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  51.02 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  51.02 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  57.14 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1189  hypothetical protein  53.12 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  46.94 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  44.9 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  47.22 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1300  hypothetical protein  55.56 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.428744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>