24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3655 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 39 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00625223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0121  hypothetical protein  78.57 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0120  hypothetical protein  78.57 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1458  hypothetical protein  78.57 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  71.43 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  71.43 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  71.43 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  77.78 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  67.86 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  75 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  67.86 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  60.71 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  70.37 
 
 		 70 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  60.71 
 
 		 63 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  66.67 
 
 		 62 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  57.69 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  70.37 
 
 		 70 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  67.86 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  67.86 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  75 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  60.71 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  59.26 
 
 		 67 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  54.55 
 
 		 70 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>