18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0934 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0934  AAA ATPase  100 
 
 		 516 aa  1040    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.895138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.61 
 
 		 1774 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  24.33 
 
 		 1022 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.92 
 
 		 1797 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.71 
 
 		 1034 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  24.18 
 
 		 1788 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 621 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  25.18 
 
 		 954 aa  47  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  37.29 
 
 		 989 aa  47  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  23.33 
 
 		 1055 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  24.17 
 
 		 1833 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  24.75 
 
 		 1837 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  30.13 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  22.97 
 
 		 1871 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  22.97 
 
 		 1836 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  22.18 
 
 		 1811 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  23.34 
 
 		 1029 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 		 1649 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>