31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1600 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 433 aa  880    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  63.88 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  51.91 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  51.37 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  52.54 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  46.89 
 
 		 414 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  47.87 
 
 		 418 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  48.02 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  46.94 
 
 		 405 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  42.76 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  42.76 
 
 		 449 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  46.21 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  40.57 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  40.57 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  42.75 
 
 		 405 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  38.73 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  31.98 
 
 		 417 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  39.1 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  32.1 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  26.72 
 
 		 421 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  29.21 
 
 		 579 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  32.22 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  28.35 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.29 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  27.34 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  26.15 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  27.5 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  26.09 
 
 		 279 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  25.63 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.41 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  27 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>