24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1634 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1634  major head protein  100 
 
 		 405 aa  823    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  49.12 
 
 		 465 aa  353  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  48.49 
 
 		 396 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  49.24 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  46.75 
 
 		 418 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  44.33 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  44.47 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  43.97 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  43.97 
 
 		 449 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  44.08 
 
 		 414 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  44.08 
 
 		 418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  42.75 
 
 		 433 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  42.47 
 
 		 405 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  41.79 
 
 		 403 aa  272  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  40.9 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  35.14 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  39.79 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  30.12 
 
 		 417 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  35.38 
 
 		 411 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  31.7 
 
 		 421 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  29.08 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  31.43 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  24.26 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5200  hypothetical protein  27.59 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.434149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>