32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3318 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 433 aa  875    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  99.54 
 
 		 433 aa  872    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  56.74 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  56.74 
 
 		 449 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  43.37 
 
 		 418 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  40.35 
 
 		 405 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  40.25 
 
 		 396 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  39.09 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  44.33 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  41.23 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  40.57 
 
 		 433 aa  275  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  40.64 
 
 		 396 aa  270  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  43.18 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  37.12 
 
 		 414 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  37.12 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  32.84 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  35.55 
 
 		 397 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  31.2 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  29.57 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  24.36 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  25.83 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.71 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  30.04 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  26.9 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  25.43 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  25.44 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  25.94 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  23.98 
 
 		 352 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  24.18 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  24.18 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2063  hypothetical protein  31.21 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  23.69 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>