23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1668 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 403 aa  815    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  53.16 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  48.94 
 
 		 418 aa  345  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  48.02 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  47.84 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  45.05 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  47.84 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  43 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  43 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  43.92 
 
 		 414 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  45.21 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  41.56 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  41.32 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  41.34 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  40.1 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  34.77 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  34.57 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  36.12 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  31.92 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  31.54 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  26.11 
 
 		 579 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  31.53 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  31.2 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>