25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0461 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  100 
 
 		 417 aa  848    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  34.75 
 
 		 418 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  31.98 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  29.91 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  40.42 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  30.65 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  33.81 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  29.72 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  29.57 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  29.57 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  31.36 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  32.86 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  29.06 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  29.06 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  32.24 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  35.23 
 
 		 405 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  31.67 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  30.98 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  28.67 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  27.6 
 
 		 579 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2837  hypothetical protein  28.98 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0998237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  23.83 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  26.5 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  26.03 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  26.03 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>