22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0649 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0649  Phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 465 aa  940    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1682  HK97 family phage major capsid protein  54.55 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1600  phage major capsid protein, HK97 family  51.91 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1668  phage major capsid protein, HK97  53.16 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  48.11 
 
 		 396 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1567  HK97 family phage major capsid protein  48.52 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.944174  decreased coverage  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1339  HK97 family phage major capsid protein  48.15 
 
 		 418 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1634  major head protein  48.87 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2963  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  47.76 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4465  phage major capsid protein, HK97 family  47.9 
 
 		 405 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  40.36 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  40.36 
 
 		 449 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3318  HK97 family phage major capsid protein  39.09 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0235436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0642  phage major head protein  44.8 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2067  prophage LambdaSo, HK97 family major capsid protein  39.09 
 
 		 433 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.023752  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  38.64 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  41.7 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0461  major phage capsid subunit precursor  29.91 
 
 		 417 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.561977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3943  HK97 family phage major capsid protein  32.93 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  30.15 
 
 		 421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3892  putative phage head  28.2 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  25.38 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>