23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0555 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  97.22 
 
 		 420 aa  780    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  97.22 
 
 		 420 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  85.82 
 
 		 417 aa  719    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  825    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  62.27 
 
 		 411 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  61.58 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  59.29 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  38.69 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  38.19 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  38.19 
 
 		 396 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  37.77 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  37.77 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  37.57 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  37.5 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  30.28 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  30.28 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  27.55 
 
 		 381 aa  122  8e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  26.68 
 
 		 403 aa  96.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  25.95 
 
 		 403 aa  96.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  24.54 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0045  hypothetical protein  26.27 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4945  hypothetical protein  24.49 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0184679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0442  outer membrane protein  26.01 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.870828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>