21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2087 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  805    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  805    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  91.92 
 
 		 396 aa  746    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  53.64 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  54.16 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  54.16 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  55.91 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  44.62 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  42.09 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  42.45 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  46.28 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  46.28 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  37.95 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  37.95 
 
 		 420 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  37.35 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  38.19 
 
 		 407 aa  243  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  32.35 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  31.48 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  32.87 
 
 		 381 aa  169  8e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  27.43 
 
 		 398 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0045  hypothetical protein  27.27 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>