21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0203 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  91.92 
 
 
396 aa  746    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  91.92 
 
 
396 aa  746    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  805    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  53.47 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  57.45 
 
 
390 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  57.45 
 
 
390 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  56.48 
 
 
347 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  44.35 
 
 
411 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  41.95 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  42.19 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  46.01 
 
 
384 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  46.01 
 
 
384 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  38.48 
 
 
420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  38.48 
 
 
420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  39.18 
 
 
417 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  38.69 
 
 
407 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  33.7 
 
 
381 aa  177  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  33.15 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  33.15 
 
 
403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  27.36 
 
 
398 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0045  hypothetical protein  26.69 
 
 
356 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>