20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4547 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  81.29 
 
 
411 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  841    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  67.78 
 
 
425 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  59.33 
 
 
420 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  59.43 
 
 
417 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  59.33 
 
 
420 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  59.66 
 
 
407 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  42.58 
 
 
396 aa  292  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  42.58 
 
 
396 aa  292  9e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  41.95 
 
 
396 aa  286  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  39.24 
 
 
390 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  39.24 
 
 
390 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  38.81 
 
 
404 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  39.06 
 
 
347 aa  215  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  29.09 
 
 
381 aa  149  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  30.38 
 
 
384 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  30.38 
 
 
384 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  29.17 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  28.4 
 
 
403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  25.26 
 
 
398 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>