20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1890 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  86.81 
 
 		 390 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  99.71 
 
 		 347 aa  693    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  86.81 
 
 		 390 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  820    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  53.64 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  53.47 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  53.64 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  44.3 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  44.3 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  40.66 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  41.58 
 
 		 411 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  38.81 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  39.34 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  37.57 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  37.57 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  37.57 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  34.11 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  34.12 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  33.65 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  31.01 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>