20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4481 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4481  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  831    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4547  hypothetical protein  80.58 
 
 
417 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  hitchhiker  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2268  hypothetical protein  66.75 
 
 
425 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.455516  normal  0.544471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2052  hypothetical protein  61.12 
 
 
417 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2100  hypothetical protein  62.63 
 
 
420 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.281286  hitchhiker  0.00458205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2376  hypothetical protein  62.63 
 
 
420 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0555  hypothetical protein  61.03 
 
 
407 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2087  hypothetical protein  43.03 
 
 
396 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2463  hypothetical protein  43.03 
 
 
396 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.385432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0203  hypothetical protein  43.03 
 
 
396 aa  299  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2529  hypothetical protein  42.19 
 
 
390 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2914  hypothetical protein  42.19 
 
 
390 aa  250  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.136153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1890  hypothetical protein  41.58 
 
 
404 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727101  normal  0.399436 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2239  hypothetical protein  41.62 
 
 
347 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.246106  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2410  hypothetical protein  33.24 
 
 
384 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2785  hypothetical protein  33.24 
 
 
384 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0937  hypothetical protein  30.08 
 
 
381 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000117538  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0525  hypothetical protein  28.68 
 
 
403 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3492  hypothetical protein  28.35 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0985  hypothetical protein  23.73 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.252055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>