103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0001 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0001  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0049  tRNA-Met  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0013  tRNA-Met  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.458419  normal  0.650447 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0023  tRNA-Met  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.665734  normal  0.468403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0016  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0017  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0018  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0009  tRNA-Met  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  88.89 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0055  tRNA-Met  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0008  tRNA-Met  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0047  tRNA-Met  94.44 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0016  tRNA-Met  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0017  tRNA-Met  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291748  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0044  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0738202  normal  0.569056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0045  tRNA-Met  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0283819  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0455  tRNA-Met  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00135587  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0004  tRNA-Met  90.2 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0005  tRNA-Met  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t029  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t030  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t56  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0633  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.811273  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  91.67 
 
 		 80 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52320  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0074  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.291778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0075  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0027  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0920329  hitchhiker  0.000285559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0038  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0258342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2749  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000330212  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4588  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0080  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0654019  normal  0.0862038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0082  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0195288  normal  0.0518693 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0083  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208848  normal  0.0528505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0102  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.872773  hitchhiker  0.00341362 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0096  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0005  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0044  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0045  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0031  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0045  tRNA-Met  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0011  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0005  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00673083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0006  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0138131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0035  tRNA-Met  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>