25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_R0044 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291748  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0004  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0283819  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0738202  normal  0.569056 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0016  tRNA-Met  100 
 
 		 79 bp  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18751  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0005  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00673083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0006  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0138131  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0040  tRNA-Met  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0001  tRNA-Met  90.2 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  89.13 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0028  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0023  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22048  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309167  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  88.24 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0028  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0089  tRNA-Met  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>