14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_R0005 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_R0005  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00673083  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0006  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0138131  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0016  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0017  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291748  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0044  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0738202  normal  0.569056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0045  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0283819  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0004  tRNA-Met  94.74 
 
 		 79 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0005  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0001  tRNA-Met  88.24 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  88.1 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0009  tRNA-Met  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.426915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>