27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_R0040 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0040  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0055  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0021  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0005  tRNA-Met  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0004  tRNA-Met  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0045  tRNA-Met  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0283819  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0016  tRNA-Met  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18751  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0017  tRNA-Met  88.68 
 
 		 79 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291748  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0044  tRNA-Met  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0738202  normal  0.569056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0017  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0009  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0016  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0047  tRNA-Met  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  86.79 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0004  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000171027  normal  0.958978 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t60  tRNA-Met  90 
 
 		 119 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0055  tRNA-Met  84.13 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.849383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>