50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_R0019 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0040  tRNA-Met  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0055  tRNA-Met  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0021  tRNA-Met  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0055  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0047  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0045  tRNA-Met  94.87 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0283819  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0004  tRNA-Met  94.87 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0005  tRNA-Met  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0017  tRNA-Met  94.87 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291748  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0016  tRNA-Met  94.87 
 
 		 79 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18751  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0044  tRNA-Met  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0738202  normal  0.569056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0009  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0018  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0017  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0016  tRNA-Met  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0006  tRNA-Met  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0138131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0005  tRNA-Met  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00673083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0040  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAMetVIMSS1309377  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.00798098  hitchhiker  0.0000123944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t60  tRNA-Met  90 
 
 		 119 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0012  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0040  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.318814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0023  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22048  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAMetVIMSS1309263  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105935 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAMetVIMSS1309167  tRNA-Met  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0013  tRNA-Met  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.458419  normal  0.650447 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0606  tRNA-Met  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1722  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0001  tRNA-Met  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-1  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1100  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000893651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0455  tRNA-Met  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00135587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>