19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0055 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0055  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0021  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0055  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0047  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0017  tRNA-Met  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0040  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0009  tRNA-Met  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0018  tRNA-Met  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0016  tRNA-Met  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0013  tRNA-Met  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.458419  normal  0.650447 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0023  tRNA-Met  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.665734  normal  0.468403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0049  tRNA-Met  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>