25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0013 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0013  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.458419  normal  0.650447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0049  tRNA-Met  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0023  tRNA-Met  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.665734  normal  0.468403 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0001  tRNA-Met  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0016  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0017  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0018  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0009  tRNA-Met  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0055  tRNA-Met  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0047  tRNA-Met  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0040  tRNA-Met  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0055  tRNA-Met  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0021  tRNA-Met  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0008  tRNA-Met  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0455  tRNA-Met  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00135587  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  88.24 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>