32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_R0026 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0040  tRNA-Met  92 
 
 
75 bp  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0017  tRNA-Met  97.92 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0018  tRNA-Met  97.92 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0016  tRNA-Met  97.92 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0009  tRNA-Met  97.92 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0023  tRNA-Met  95.83 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.665734  normal  0.468403 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  88 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0049  tRNA-Met  93.75 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t60  tRNA-Met  97.5 
 
 
119 bp  71.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0021  tRNA-Met  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0055  tRNA-Met  88.89 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0001  tRNA-Met  88.89 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0055  tRNA-Met  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0040  tRNA-Met  86.67 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  88.89 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0044  tRNA-Met  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0738202  normal  0.569056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0045  tRNA-Met  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0283819  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0017  tRNA-Met  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291748  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0004  tRNA-Met  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0005  tRNA-Met  90.57 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0016  tRNA-Met  90.57 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0013  tRNA-Met  91.67 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.458419  normal  0.650447 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0049  tRNA-Met  88.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0048  tRNA-Met  88.68 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.169454  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0047  tRNA-Met  85.71 
 
 
75 bp  54  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0064  tRNA-Met  89.13 
 
 
77 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00167035  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0032  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAMetVIMSS1309108  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0004  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000171027  normal  0.958978 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0006  tRNA-Met  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0138131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0005  tRNA-Met  88.1 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00673083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>