21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ABOO_t60 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  ABOO_t60  tRNA-Met  100 
 
 		 119 bp  236  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0026  tRNA-Met  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0017  tRNA-Met  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0009  tRNA-Met  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0018  tRNA-Met  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0016  tRNA-Met  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0023  tRNA-Met  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.665734  normal  0.468403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0047  tRNA-Met  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0055  tRNA-Met  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t5  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 126 bp  52  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t30  tRNA-Ile  96.97 
 
 		 124 bp  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0001  tRNA-Met  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.897031  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0040  tRNA-Met  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0019  tRNA-Met  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.456495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0049  tRNA-Met  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0016  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0039  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0050  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  46.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0037  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0044  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>