33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1881 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1881  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  158  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0274426  normal  0.789629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  53.52 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3725  hypothetical protein  64.52 
 
 
73 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.320856  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0616  membrane protein-like protein  40.54 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000019753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  42.31 
 
 
78 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1579  hypothetical protein  40 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0952  hypothetical protein  45.83 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1384  hypothetical protein  38.55 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.958099  normal  0.904414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0602  membrane protein-like protein  38.89 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000788004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0935  hypothetical protein  38.46 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_823  hypothetical protein  46.05 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0836  hypothetical protein  40.79 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2112  hypothetical protein  47.95 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1577  hypothetical protein  47.95 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2159  hypothetical protein  35.44 
 
 
85 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.518894  normal  0.0709956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1153  hypothetical protein  44.16 
 
 
94 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0014547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00160  predicted membrane protein  41.27 
 
 
85 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0162  hypothetical protein  38.64 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000600973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1724  hypothetical protein  40.35 
 
 
58 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0764  hypothetical protein  42.86 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2278  hypothetical protein  37.35 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1380  hypothetical protein  34.25 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0768  hypothetical protein  48.08 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.653371  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0211  hypothetical protein  42.37 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.334507  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0036  hypothetical protein  46.67 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1280  hypothetical protein  34.78 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.240196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1408  hypothetical protein  32.86 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2065  hypothetical protein  36.23 
 
 
87 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.66458  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2438  hypothetical protein  36.23 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.386115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2978  hypothetical protein  37.5 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2725  hypothetical protein  37.65 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.057147  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>