44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1718 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1718  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  426  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0612  hypothetical protein  41.59 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400174  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02006  hypothetical protein  39.91 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4860  hypothetical protein  39.47 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3943  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  37.96 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.118418 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3830  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  37.96 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.777067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1956  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.92 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.901349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2035  hypothetical protein  36.92 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1179  hypothetical protein  41.9 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0199  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  40.37 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4026  periplasmic ligand-binding sensor protein  37.44 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0077  hypothetical protein  31.9 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3073  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.45 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2048  hypothetical protein  37.1 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2807  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.65 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.150844  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4926  periplasmic ligand-binding sensor protein  27.97 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3266  hypothetical protein  29.29 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1337  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.15 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1777  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.77 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3819  hypothetical protein  38.89 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666995  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3092  hypothetical protein  38.89 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4721  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.97 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5408  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.59 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3004  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  25.45 
 
 		 250 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3191  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.93 
 
 		 276 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1339  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.14 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1677  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2783  periplasmic ligand-binding sensor protein  28.39 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204323  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3674  hypothetical protein  33.57 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.907112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18090  hypothetical protein  25.65 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2633  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.49 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4645  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.559684  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2569  hypothetical protein  32.93 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.69877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4783  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.57 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0806  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.29 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2881  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.05 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4770  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.57 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3107  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.05 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335177  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1890  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.29 
 
 		 278 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4121  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.93 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1156  hypothetical protein  28.83 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0451536  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0575  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.57 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000133635  hitchhiker  0.0000000000000166564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4667  hypothetical protein  26.4 
 
 		 265 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1842  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.71 
 
 		 289 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>