45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0575 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0575  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  100 
 
 		 248 aa  473  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000133635  hitchhiker  0.0000000000000166564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3073  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.48 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2807  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.6 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.150844  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5408  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.06 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3004  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.65 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4926  periplasmic ligand-binding sensor protein  37.81 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3266  hypothetical protein  33.47 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.172052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4783  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  38.58 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3107  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.8 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335177  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2881  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.8 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0077  hypothetical protein  28 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1718  hypothetical protein  31.08 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.580587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4645  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  37.56 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.559684  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2048  hypothetical protein  29.38 
 
 		 177 aa  71.6  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0651  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.16 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3830  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.19 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.777067 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3943  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.19 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.118418 
 
 
-
 
NC_003296  RS02006  hypothetical protein  33.18 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1339  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.84 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2633  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.46 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18090  hypothetical protein  28.35 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4770  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  38.07 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1156  hypothetical protein  31.47 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0451536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3651  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.31 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3700  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.3 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.997851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2783  periplasmic ligand-binding sensor protein  34.59 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1956  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28.57 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.901349  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4667  hypothetical protein  35.26 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4302  hypothetical protein  33.05 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.216164  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4860  hypothetical protein  29.92 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1179  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0612  hypothetical protein  33.94 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400174  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12740  hypothetical protein  32.16 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00175041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1777  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.55 
 
 		 284 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1337  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.67 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3092  hypothetical protein  35.67 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3819  hypothetical protein  35.67 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666995  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3674  hypothetical protein  40.3 
 
 		 165 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.907112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1890  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.34 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0806  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  31.43 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115635 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4026  periplasmic ligand-binding sensor protein  35.75 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4721  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.32 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0189  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  56.86 
 
 		 240 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135846  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3191  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.63 
 
 		 276 aa  42  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>