31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12740 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12740  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00175041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1156  hypothetical protein  94.24 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0451536  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2633  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  57.79 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1339  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  56.49 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1006  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  48.15 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4667  hypothetical protein  43.65 
 
 		 265 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4783  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  42.35 
 
 		 252 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4302  hypothetical protein  43.37 
 
 		 234 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.216164  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4926  periplasmic ligand-binding sensor protein  42.56 
 
 		 252 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4645  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  42.77 
 
 		 252 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.559684  normal  0.0427869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0651  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  42.64 
 
 		 253 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4770  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  43.6 
 
 		 252 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291324  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3700  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  41.15 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.997851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18090  hypothetical protein  40.97 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3073  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.57 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2807  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.85 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.150844  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5408  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  38.24 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2048  hypothetical protein  29.61 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3266  hypothetical protein  37.33 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.172052  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0077  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3004  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  38.03 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2881  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.04 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3107  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  35.04 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335177  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2783  periplasmic ligand-binding sensor protein  33.88 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204323  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0575  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  61.36 
 
 		 248 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000133635  hitchhiker  0.0000000000000166564 
 
 
-
 
NC_003296  RS02006  hypothetical protein  31.09 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3651  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.43 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015395 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1956  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.901349  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3819  hypothetical protein  35.38 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.666995  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3092  hypothetical protein  35.38 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>