More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03240 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03240  Cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 244 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.21 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  28.63 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  28.29 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.48 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.21 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3569  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.00440484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.65 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  30.65 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  30.23 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.48 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197131  normal  0.373093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1450  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000235787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.96 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  29.96 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  28.12 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  28.97 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.06 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  28.46 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.46 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.6 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  28.74 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 		 294 aa  99  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.69 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  29.53 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.37 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  29.44 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4840  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.23 
 
 		 337 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.6 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.01 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.6 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1114  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.28 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.114228  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  28.8 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.1 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  30.4 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0045  Slp  31.69 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.014209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  31.05 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.15 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.56 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1680  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.69 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0266407  hitchhiker  0.00479585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.4 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.17 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.53 
 
 		 267 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.49 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.57 
 
 		 315 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  28 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0054  chromosome segregation ATPase  25.2 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.96 
 
 		 304 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  27.09 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  30.89 
 
 		 330 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  27.89 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.03 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  28.3 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  27.69 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.63 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.63 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  28.63 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  30.83 
 
 		 341 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.63 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  28.63 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.63 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.2 
 
 		 346 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 		 339 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.24 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 		 470 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1467  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.73 
 
 		 274 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.162034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  29.69 
 
 		 305 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1407  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.44 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.63 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 		 322 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.15 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3749  hypothetical protein  26.61 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.1 
 
 		 295 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>