47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0758 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  100 
 
 
192 aa  383  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  40.11 
 
 
205 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  35.87 
 
 
181 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  35.87 
 
 
181 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  35.87 
 
 
192 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  36.41 
 
 
192 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  36.41 
 
 
192 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  36.41 
 
 
192 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  35.87 
 
 
192 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  35.87 
 
 
192 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  35.87 
 
 
192 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  35.87 
 
 
192 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  35.33 
 
 
192 aa  120  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  36.87 
 
 
179 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1205  hypothetical protein  30.98 
 
 
192 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000216988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  31.89 
 
 
194 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  29.73 
 
 
193 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  35.8 
 
 
198 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  32.14 
 
 
194 aa  98.2  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  31.43 
 
 
248 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  31.25 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  30.69 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  30.18 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  26.67 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  25.63 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  28.26 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  30.27 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1000  hypothetical protein  27.03 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0805634  normal  0.842682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  29.03 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24050  predicted membrane protein  26.74 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  28.14 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1295  hypothetical protein  29.19 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.024719  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  27.72 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  27.78 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  25.84 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3408  hypothetical protein  27.65 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  28.19 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0850  riboflavin transporter  28.12 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2810  membrane protein-like protein  26.88 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000163622  hitchhiker  0.0000000982148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  24.73 
 
 
183 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  25.93 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  30.72 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  26.49 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1576  riboflavin transporter  40 
 
 
78 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90193e-44 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1339  hypothetical protein  22.02 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000160221  normal  0.76109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>