30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1295 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1295  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  381  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.024719  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  40.84 
 
 
194 aa  139  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  46.11 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  41.53 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  32.29 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  29.05 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  29.19 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  29.02 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  31.98 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  31.98 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  25.5 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  28.28 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  29.41 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  32.35 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  25.79 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  29.21 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  26.44 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  26.67 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  26.67 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  26.67 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  23.53 
 
 
183 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  25.6 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  25.65 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  25.73 
 
 
198 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>