40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0802 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  100 
 
 
186 aa  360  7.0000000000000005e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  38.2 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  33.53 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  33.53 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  33.9 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  34.35 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0850  riboflavin transporter  28.73 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  34.35 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  27.17 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  36.43 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  30.68 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1295  hypothetical protein  27.78 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.024719  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  32.06 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  25.68 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  31.95 
 
 
192 aa  55.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  33.82 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  30.05 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  32.09 
 
 
193 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  32.68 
 
 
185 aa  54.3  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  28.18 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  31.3 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  27.62 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  25.61 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  39.29 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  30.37 
 
 
194 aa  45.4  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  30.87 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  39.29 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2810  membrane protein-like protein  24.28 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000163622  hitchhiker  0.0000000982148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  24 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  28.3 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  24.7 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>