47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1596 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  70.98 
 
 
194 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  53.55 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  54.1 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  54.1 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  54.1 
 
 
192 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  53.55 
 
 
192 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  53.01 
 
 
192 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  53.01 
 
 
192 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  53.01 
 
 
192 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  51.91 
 
 
192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1205  hypothetical protein  54.4 
 
 
192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000216988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  42.22 
 
 
181 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  42.22 
 
 
181 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  42.54 
 
 
179 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  39.79 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  36.55 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  36.6 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  36.69 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  36.69 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  29.73 
 
 
192 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  31.31 
 
 
198 aa  100  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  34.09 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  30.57 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  28.88 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  30.85 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1576  riboflavin transporter  57.97 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90193e-44 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  37.07 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  30.77 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  37.17 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  32.97 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  32.42 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  32.9 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3408  hypothetical protein  26.84 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1000  hypothetical protein  27.84 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0805634  normal  0.842682 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0850  riboflavin transporter  31.72 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  26.7 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  30.48 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  30.16 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  24.86 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  28 
 
 
189 aa  55.5  0.0000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  32.09 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1295  hypothetical protein  25.79 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.024719  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24050  predicted membrane protein  29.57 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2810  membrane protein-like protein  28.65 
 
 
195 aa  51.6  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000163622  hitchhiker  0.0000000982148 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  25.45 
 
 
186 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08330  predicted membrane protein  28.15 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>