45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1221 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  377  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  44.33 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  43.52 
 
 
198 aa  165  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  37.04 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  37.11 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  38.83 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  38.83 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  36.55 
 
 
193 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  35.03 
 
 
194 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  34.02 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  34.02 
 
 
192 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  33.51 
 
 
192 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  36.9 
 
 
179 aa  101  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  34.03 
 
 
198 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  34.03 
 
 
198 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1205  hypothetical protein  35.94 
 
 
192 aa  94.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000216988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  31.96 
 
 
180 aa  94.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  38.74 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  37.37 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  32.35 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  36.79 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  28.19 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  25.63 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1000  hypothetical protein  27.66 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0805634  normal  0.842682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  29.63 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  30.32 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24050  predicted membrane protein  30.32 
 
 
187 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  29.84 
 
 
185 aa  58.9  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  29.38 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  29.17 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  33.82 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2810  membrane protein-like protein  27.62 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000163622  hitchhiker  0.0000000982148 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  28.42 
 
 
206 aa  51.2  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3408  hypothetical protein  24.21 
 
 
183 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0850  riboflavin transporter  29.12 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  29.53 
 
 
174 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1295  hypothetical protein  25.65 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.024719  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  25.99 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>