42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0344 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  100 
 
 
248 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  38.58 
 
 
198 aa  142  7e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  36.79 
 
 
194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  37.11 
 
 
194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  37.17 
 
 
192 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  36.6 
 
 
193 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  37.7 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  37.7 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  37.7 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  37.17 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  37.17 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  37.17 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  37.17 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  38.33 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  37.78 
 
 
198 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  36.98 
 
 
181 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  36.98 
 
 
181 aa  115  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  34.9 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  35.42 
 
 
194 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  35.42 
 
 
179 aa  105  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1205  hypothetical protein  35.08 
 
 
192 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000216988  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  31.43 
 
 
192 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  29.24 
 
 
221 aa  89  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  29.95 
 
 
194 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1000  hypothetical protein  27.27 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0805634  normal  0.842682 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  30.73 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  30.21 
 
 
188 aa  79  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  29.3 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  28.28 
 
 
180 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  32.24 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  30.57 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24050  predicted membrane protein  28.21 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3408  hypothetical protein  25.64 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  30.89 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  28.06 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  27.78 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  29.79 
 
 
194 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1295  hypothetical protein  28.28 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.024719  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  24.87 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  26.4 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  30.05 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  24.75 
 
 
189 aa  50.1  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>