41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0354 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  39.89 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  41.08 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1000  hypothetical protein  36.46 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0805634  normal  0.842682 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  38.95 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2810  membrane protein-like protein  39.33 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000163622  hitchhiker  0.0000000982148 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  36.21 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3408  hypothetical protein  32.04 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  32.95 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24050  predicted membrane protein  32.61 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  33.15 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0850  riboflavin transporter  31.49 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  31.4 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  32.6 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  32.6 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  32.6 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  32.6 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  32.6 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  32.6 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  32.6 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  30.29 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  31.69 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  28.32 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  32.9 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  26.14 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  32.73 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  27.75 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  32.02 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  32.02 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  27.72 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1205  hypothetical protein  28.85 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000216988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  24.87 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  32.57 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  30.85 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  25.65 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  29.19 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  25.99 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  30.46 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>