48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1053 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1053  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  338  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1572  hypothetical protein  74.3 
 
 
181 aa  276  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1541  hypothetical protein  74.3 
 
 
181 aa  276  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.325008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1404  hypothetical protein  44.44 
 
 
192 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000767821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1643  hypothetical protein  42.22 
 
 
192 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000917387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1363  hypothetical protein  42.22 
 
 
192 aa  154  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000746858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1364  hypothetical protein  42.22 
 
 
192 aa  154  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.70731e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1606  hypothetical protein  41.67 
 
 
192 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000535134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1537  hypothetical protein  41.67 
 
 
192 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1502  hypothetical protein  41.11 
 
 
192 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3808  hypothetical protein  41.11 
 
 
192 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183657  hitchhiker  1.43383e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1391  hypothetical protein  41.11 
 
 
192 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000115789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1596  hypothetical protein  42.54 
 
 
193 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2572  hypothetical protein  41.48 
 
 
194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1205  hypothetical protein  41.11 
 
 
192 aa  134  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000216988  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0758  membrane protein-like protein  36.87 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000615042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0486  membrane protein-like protein  33.86 
 
 
194 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0181  hypothetical protein  33.87 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000672216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1221  hypothetical protein  36.9 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2425  hypothetical protein  36.63 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0344  membrane protein-like protein  35.42 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00594365  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2135  hypothetical protein  36.63 
 
 
198 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0890  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000000000156901 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2801  hypothetical protein  31.89 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0607  hypothetical protein  29.03 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1033  membrane protein-like protein  34.64 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0677778  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0314  hypothetical protein  32.79 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000578872  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12550  predicted membrane protein  29.21 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0435  membrane protein-like protein  37.08 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000882903  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1000  hypothetical protein  28.41 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0805634  normal  0.842682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1403  hypothetical protein  31.25 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10970  predicted membrane protein  33.15 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000439104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1347  membrane protein-like protein  31.11 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1339  membrane protein-like protein  35.43 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0850  riboflavin transporter  38.01 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.243447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2810  membrane protein-like protein  29.14 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000163622  hitchhiker  0.0000000982148 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3408  hypothetical protein  27.07 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24050  predicted membrane protein  26.7 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1295  hypothetical protein  31.91 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.024719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1576  riboflavin transporter  43.94 
 
 
78 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.90193e-44 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0354  hypothetical protein  32.57 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1395  hypothetical protein  27.46 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00518816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0802  membrane protein-like protein  32.06 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0056  hypothetical protein  24.56 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.553669  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0245  hypothetical protein  37.04 
 
 
198 aa  52  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0823  hypothetical protein  25.56 
 
 
189 aa  52.4  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1680  hypothetical protein  30.86 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.665126  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1339  hypothetical protein  28.74 
 
 
203 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000160221  normal  0.76109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>